Car-tech

IBM sa Commercialize Genome Reading

The Decline of IBM

The Decline of IBM
Anonim

IBM ay nakipagsosyo sa Roche, isang tagagawa ng mga medikal na aparato, upang bumuo ng isang mababang gastos na aparato na maaaring magbasa ng mga genome ng tao, inihayag ng kumpanya ang Huwebes.

Kahit na ang teknolohiya ay maaaring pa rin ng isang dekada o higit pa ang layo mula sa komersyalisasyon, kapag natapos ito ay dapat magbigay sa bawat doktor ng isang mababang gastos at mabilis na paraan ng pagsusuri ng genomic makeup ng isang pasyente, sinabi Ajay Royyuru, senior manager ng computational biology sa IBM Research.

"Ang halaga ng genome sequencing ay bumaba, at ang bilis ay nagsimula upang mapabuti, ngunit may mga problema pa rin sa bilis, sukat, throughput, pati na rin ang gastos, "sabi ni Royyuru.

Ang proyekto ay gagamit ng" DNA Transistor ng IBM. " Ang mga transistors na ito ay naglalaman ng nanopores, o napakaliit na pores, sa pamamagitan ng bawat isa na ang isang strand ng deoxyribonucleic acid (DNA) ay maaaring tumakbo. Ang nanopore ay nagpapakilala sa bawat batayan ng DNA sa pamamagitan ng paggamit ng isang electric field.

Dahil ang nanopore ay ginawa sa bahagi mula sa silikon, dapat itong ma-mass-produce ng parehong diskarte sa litograpya na ginagamit upang gumawa ng mga microprocessors, kaya pinapanatili ang produksyon

Habang ang iba pang mga mananaliksik ay may ginalugad din ang paggamit ng mga nanopore, ang mga disenyo ay hindi maaaring tumpak na basahin ang DNA, dahil ang DNA ay mabilis na naglakbay sa pamamagitan ng pore.

"Ito ay tulad ng ng sanggol sa spaghetti. Nagsisimula na lumipat sa nanopore, napupunta ito nang mabilis. Nakita namin na 48,000 mga yunit ng DNA ay dumadaan sa 10 o 20 milliseconds Sa bilis na mayroon kang napakaliit na pagkakataon ng pagbabasa nang tama, "sabi ni Royyuru. bilis ng DNA, ang IBM ay gumawa sa nanopore ng elektrikal na kontrol upang mag-dial ng daloy sa nais na bilis. "Maaari naming kontrolin ang kilusan ng DNA sa pamamagitan ng pores, maaari naming isulong ang yunit sa pamamagitan ng yunit," sabi niya.

Kahit na ang mga DNA sequencing technology ay nasa paligid mula noong unang bahagi ng 1970s, ang buong genome ng tao ay hindi na-decoded sa kabuuan nito hanggang 2001, dahil sa automat na kinakailangan upang mabasa ang mga malalaking numero ng mga pares ng base na kailangang mabasa. Ang bawat tao DNA ay naglalaman ng tungkol sa 3 bilyong base pairs ng nucleotides.

Habang ang DNA sequencing technology ay napabuti mula noon, nagkakahalaga pa rin ito ng ilang daang libong dolyar upang basahin ang isang buong genome ng tao, sinabi ni Royyuru. Kapag handa na, ang aparatong ito ay dapat magawa ang trabaho sa kahit saan mula sa US $ 100 hanggang $ 1,000 bawat nabasa, Royyuru tinantiya.

Royyuru ay tinanggihan upang mag-alok ng isang oras kapag ang makina ay magiging komersiyal na magagamit, sa pagbanggit sa maraming mga hakbang na kailangan upang dalhin radikal na bagong teknolohiya sa produksyon. Tinatayang umabot na ang mga ito sa loob ng limang hanggang 10 taon upang tapusin ang pananaliksik nang mag-isa.

Roche's sequencing subsidiary, 454 Life Sciences, sa huli ay mag-market sa mga nagresultang produkto na nanggagaling sa pakikipagtulungan. Ang IBM ay magdadala sa pakikipagsosyo sa kadalubhasaan nito sa pagtatayo ng electronics at pamamahala ng data, habang inilalapat ni Roche ang kaalaman nito sa mga medikal na diagnostic at genome sequencing, sinabi ni Royyuru.

Binabasa ang isang genetic code ng indibidwal na maaaring magkaroon ng maraming benepisyong medikal, sinabi ni Royyuru. Karamihan sa mga kapansin-pansin ay pahihintulutan nito ang mga doktor na "isapersonal ang pagkakaloob ng pangangalagang medikal," sabi niya. Halimbawa, maraming gamot ang gagana sa ilan, ngunit hindi lahat, mga tao. Ang pagkakaroon ng DNA ng isang tao sa kamay ay makakatulong sa isang doktor na magreseta ng naaangkop na gamot. Gayundin, ang pagbabasa ng genome ay maaaring ihayag ang pagkamaramdamin sa ilang mga sakit.

Marahil ang isa pang maagang paggamit ay maaaring sa pagtukoy kung gaano katagal ang mga indibidwal na maaaring mabuhay. Sa Huwebes, inihayag ng mga mananaliksik ng Boston University na natagpuan nila kung ano ang lumilitaw na genetic signature ng mahabang buhay.

Sinasaklaw ni Joab Jackson ang software sa pagmumuni-muni at ang pangkalahatang teknolohiya ng breaking balita para sa

Ang IDG News Service. Sundin si Joab sa Twitter sa @Joab_Jackson. Ang e-mail address ni Joab ay [email protected]